Milk safety: antibiotic residues and resistance profiles of Escherichia coli strains isolated from milk produced and sold in the Houêt and Kadiogo provinces of Burkina Faso

Authors

  • Innocent DABIRE Université Nazi Boni
  • Salimata POUSGA
  • Madi SAVADOGO
  • Sèna Hervé VITOULEY
  • Laibané Dieudonné DAHOUROU

DOI:

https://doi.org/10.64707/revstsna.v45i01.2188

Keywords:

cattle, antibiotic residues, milk, food safety, Burkina Faso

Abstract

In Burkina Faso, the quality of milk was compromised. The aim of this study was to
determine the prevalence and antibiotic resistance profile of Escherichia coli strains
isolated from milk. A total of 150 farms were surveyed, and samples from these farms
were collected in Ouagadougou and Bobo-Dioulasso. The detection and confirmation
of antibiotic residues were carried out using Delvotest T and ELISA kits.
Concentrations were determined by High-Performance Liquid Chromatography
(HPLC). Antibiotic susceptibility testing of the samples was performed using the disc
diffusion method. The isolates were tested against 10 commonly used antibiotics
using the agar diffusion method. Good hygiene practices were less satisfactory on
traditional farms (46.43% and 60.0%) and modern farms (18.18% and 55.0%) in
Ouagadougou and Bobo-Dioulasso, respectively. The prevalence of antibiotic
residues was 36% and 45%. The average concentrations exceeded the Maximum
Residue Limits (MRLs) for beta-lactams (61.73 ± 54.95 μg/L). The overall
exceedance rate was 65.2 per cent. The prevalence of Escherichia coli strains was
47.5 per cent in Ouagadougou and 54.84 per cent in Bobo-Dioulasso. Beta-lactam-
resistant strains (4.69 per cent for amoxicillin and 7.81 per cent for penicillin G) were
identified in the milk. An integrated public health perspective, consistent with the
‘One Health’ approach, as well as a multisectoral approach to promoting alternatives,
was required.

References

Amal, B.M., et al. (2023) Recherche de résidus d’antibiotiques dans le

lait cru d’origine bovine. Mémoire de Master, Université Mouloud

Mammeri de Tizi-Ouzou, Algerie, pp. 1–80.

Aoues, et al. (2019) Détection des résidus d’antibiotiques dans le lait

cru de vache collecté dans la région de Blida (Algérie). Revue

Agrobiologie, 9(1), pp. 1214–1222.

Ba, et al. (2019) Résistance aux antibiotiques des souches de

Staphylococcus aureus et des Enterobacteriaceae isolés au LNSP de

Ouagadougou (Burkina Faso). Science et Technique, Sciences de la

Santé, 42(1), pp. 83–94.

Bagré, T.S., Kagambega, A., Bawa, H.I. and Bsadjo, G. (2013)

Antibiotic susceptibility of Escherichia coli and Salmonella strains

isolated from raw and curds milk consumed in Ouagadougou and

Ziniaré, Burkina Faso. African Journal of Microbiology Research,

(35), pp. 4431–4437.

Bagré, T., Samandoulougou, S., Traoré, M., Illy, D., Bsadjo-Tchamba,

G., Bawa-Ibrahim, H., Bouda, S., Traoré, A. and Barro, N. (2015)

Détection biologique des résidus d’antibiotiques dans le lait et produits

laitiers de vache consommés à Ouagadougou, Burkina Faso. Journal of

Applied Biosciences, 87(1), pp. 8105–8115.

Barbot, D., Begon, E., Bietrix, J., Demay, F., Orand, J.P. and Verdier,

G. (2021) Surveillance des médicaments vétérinaires en post-AMM :

Rapport annuel 2021. ANSES, HAL Open Science, pp. 1–65.

Bâtie, C. (2018) Perception des risques liés à l’utilisation des

antibiotiques dans les élevages de porcs et de volailles à Madagascar.

Thèse de Doctorat en Médecine Vétérinaire, École Nationale

Vétérinaire de Toulouse, France, pp. 1–128.

Bedekelabou, A.P., Penoukou, E.K., Niang, E. and Gbati, O.B. (2021)

Dépistage des résidus de quelques antibactériens dans le lait et les œufs

produits dans les régions de Dakar et de Thiès au Sénégal. Revue

Marocaine des Sciences Agronomiques et Vétérinaires, 9(2), pp. 190–

Bendjebbara, B. (2024) Prévalence et antibiorésistance des souches

d’Escherichia coli isolées de lait cru dans la région d’Ain Témouchent.

Mémoire de Master, Université Belhadj Bouchaib - Ain Témouchent,

Algerie, pp. 1–92.

Vol. 45, n° 1– janvier – juin 2026 – Sciences Naturelles et Appliquées - Publié le 30 juin 2026 753

Benzekri, I. and Menia, M.A. (2019) Enquête sur les conditions

d’utilisation des antibiotiques chez vétérinaires et éleveurs de la wilaya

de Djelfa. Mémoire de fin d’études, Université de Djelfa, Algérie, pp.

–75.

Bhoomika, S., Anil, P. and Eknath, G.N. (2016) Occurrence and

characteristics of extended-spectrum β-lactamases producing

Escherichia coli. Veterinary World, 9(9), pp. 996–1000.

Boireau, C.E., Morignat, G., Cazeau, N., Jarrige, E., Jouy, M., Haenni,

M., Madec, J.Y.,

Cheng, J., Qu, W., Barkema, H.W., Nobrega, D.B., Gao, J., Liu, G., De

Buck, J., Kastelic, J.P., Sun, H. and Han, B. (2018) Antimicrobial

resistance profiles in dairy herds. Journal of Dairy Science, 102(3), pp.

–2426.

Drugea, R. I., Siteavu, M. I., Pitoiu, E., Delcaru, C., Sârbu, E. M.,

Postolache, C., & Bărăităreanu, S. (2025). Prévalence et résistance aux

antibiotiques d’Escherichia coli isolées du lait de vache

cru. Microorganisms, 13(1), 209.

https://doi.org/10.3390/microorganisms13010209 DOI: https://doi.org/10.3390/microorganisms13010209

Egide, S., Mensah, P., Yelindo, K., Brice, K., Salifou, S., Appolinaire,

G., Sanders, P. and Adebayo, F. (2019) Évaluation des résidus de

tétracyclines et de bêta-lactamines. Revue d’Élevage et de Médecine

Vétérinaire des Pays Tropicaux, 73(1), pp. 25–32.

FAOSTAT. 2024. Production / Cultures et produits animaux -

Métadonnées. Food and Agriculture Organization of the United Nations

(FAO), Statistics Division (ESS), Crops, Livestock and Food Statistics

Team https://www.fao.org/faostat/fr/#data/QCL

Gaffaf, and Ghrieb, (2018) Prévalence et antibiorésistance des souches

d’Escherichia coli isolées du lait cru. Mémoire de Master, Université

Larbi Tébessa, pp. 1–101.

Gaouar, Z. L et al. (2021). Les résidus d’antibiotiques dans le lait cru

de vache : état des lieux dans la région de l’Ouest Algérien. J. Fac. Med.

Or. 5(1):653-660. DOI : https://doi.org/10.51782/jfmo.v5i1.117 DOI: https://doi.org/10.51782/jfmo.v5i1.117

Imarazene, and Lariouat, (2023) Détection des résidus d’antibiotiques

dans le lait cru. Mémoire de Master, Université Mouloud Mammeri de

Tizi-Ouzou, pp. 1–89.

Vol. 45, n° 1– janvier - juin 2026 – Sciences Naturelles et Appliquées - Publié le 30 juin 2026

Islam, M.A., Kabir, S.M.L. and Seel, S.K. (2016) Molecular detection

of Escherichia coli. Bangladesh Journal of Veterinary Medicine, 14(2),

pp. 271–275.

Liu, H., Meng, L., Dong, L., Zhang, Y., Wang, J. and Zheng, N. (2021)

Prevalence and molecular characterization of E. coli. Frontiers in

Microbiology, 12(1), pp. 730656.

MAERAH. 2024. Elevage au Burkina Faso : La stratégie nationale de

développement de la filière en cours de validation.

https://www.agriculture.bf/jcms/pv10_104293/fr/aviculture-au-

burkina-faso-la-strategie-nationale-de-developpement-de-la-filiere-en-

cours-de-validation Mensah, S.E.P., Koudande, O.D., Sanders, P. and

Laurentie, M. (2014) Résidus d’antibiotiques et risques de santé

publique. Revue Scientifique et Technique de l’OIE, 33(3), pp. 975–

Nüesch-Inderbinen, M., Käppeli, N., Morach, M., et al. (2019)

Molecular types and antimicrobial resistance of E. coli. Veterinary

Record, 185(24), pp. 788–794.

Okombe, V.L., Loboya, M., Nzuzi, M. and Pongombo, S. (2016).

Détection des résidus d’antibiotiques. Journal of Applied Biosciences,

(1), pp. 9763–9770.

Ouédraogo, S.E., Sodré, K.I., Savadogo, L., Sanou, V.M.C., Bougouma

(2023). Performances de production des élevages laitiers périurbains et

urbains de la commune de Fada N’Gourma au Burkina Faso. Rev. Mar.

Sci. Agron. Vét. 11(3). pp. 351 à 359. DOI

:10.5281/ZENODO.8287468.

Oulai, J. (2004). Distribution et utilisation des médicaments

vétérinaires en Côte d’Ivoire : Cas de la région des lagunes. Thèse

Doctorat en médecine vétérinaire, École Inter-États des Sciences et

Médecine Vétérinaires, Côte d’Ivoire. 110

p. http://www.beep.ird.fr/collect/eismv

Rabee, A., Ombarak, A.H., Sharda, P.A., et al. (2016) Prevalence of E.

coli in raw milk. International Journal of Food Microbiology, 221(1),

pp. 69–76.

RECA (Réseau National des Chambres d’Agriculture du Niger), 2022.

Mieux connaître les médicaments illicites dans les communes pour

informer les éleveurs. Répertoire des produits zootechniques et

vétérinaire No. 2.

Vol. 45, n° 1– janvier – juin 2026 – Sciences Naturelles et Appliquées - Publié le 30 juin 2026 755

Saïdani, M., Soudani, A., Daaloul, M., et al. (2016) Prévalence et

antibiorésistance d’E. coli. Revue de l’Institut National Agronomique

de Tunisie, 162(4), pp. 45–52.

Saïdani, M., Messadi, L., Soudani, A., et al. (2018) Epidemiology and

antimicrobial resistance. Microbial Drug Resistance, 24(9), pp. 1242–

Samandoulougou, S., Compaore, H. and Tapsoba, F.W. (2021) Qualité

sanitaire des gésiers de poulets. Journal of Applied Biosciences, 167(1),

pp. 17335–17347.

Sanders, P., Perrin-Guyomard, A. and Moulin, G. (2017) Évolution de

l’utilisation des antibiotiques. Cahiers de Nutrition et de Diététique,

(6), pp. 301–311.

Savadogo, A., Ouattara, C.A.T., Ilboudo, A.J., Karou, K. and Traore,

A.S. (2010) Isolation of bacterial strains from fermented milk. Advance

Journal of Food Science and Technology, 2(2), pp. 91–95.

Soma, D., Juste, I., Bonkoungou, O., et al. (2024) ESBL-producing and

multidrug-resistant E. coli and Klebsiella. Microorganisms, 12(4), pp.

Srinivasan, V., Gillespie, B.E., Lewis, M.J., et al. (2007) Antimicrobial

resistance patterns of E. coli. Veterinary Microbiology, 124(3–4), pp.

–328.

Touguelyghan, K.Y. (2011) Résidus d’antibiotiques dans les viandes

bovines. Thèse de Doctorat en Médecine Vétérinaire, EISMV Dakar,

Sénégal, pp. 1–89.

Victor, O.E., Wa, L., Roger, L. and Gael, N.M. (2016) Détection des

résidus d’antibiotiques. Journal of Applied Biosciences, 102(1), pp.

–9770.

Yacina, S.S., Madougou, M.A. et al. (2025). Évaluation de la

susceptibilité aux antimicrobiens des souches de Salmonella spp. et

Escherichia coli isolées du lait cru de vache dans la zone périurbaine de

Niamey (Niger) Journal of Applied Biosciences 214 : 22689 – 22697

ISSN 1997-5902. https://doi.org/10.35759/JABs.214.4

Yassine, B.L., Elmostapha, B., Adil, M., Chadli, M. and Elouennass,

M. (2020) Résistance aux antibiotiques d’Escherichia coli. Journal

Marocain des Sciences Médicales, 22(1), pp. 12-18.

Vol. 45, n° 1– janvier - juin 2026 – Sciences Naturelles et Appliquées - Publié le 30 juin 2026

Zanarotti, V. (2021) L’antibiogramme en médecine vétérinaire rurale :

utile, indispensable ou superflu ? Le guide du praticien en médecine des

animaux de production, Sciences du Vivant pp. 1-110.

Published

2026-06-30

How to Cite

DABIRE, I., POUSGA, S., SAVADOGO, M. ., VITOULEY, S. H. ., & DAHOUROU, L. D. (2026). Milk safety: antibiotic residues and resistance profiles of Escherichia coli strains isolated from milk produced and sold in the Houêt and Kadiogo provinces of Burkina Faso. Sciences Naturelles Et Appliquées, 45(01), 733–756. https://doi.org/10.64707/revstsna.v45i01.2188