Optimisation de l'isolement des champignons entomopathogènes Metarhizium spp. inféodés à la rhizosphère et aux insectes dans l'Ouest du Burkina Faso dans le cadre de la lutte contre le paludisme

Résumé

Le paludisme est la principale cause de consultation, d’hospitalisation et de décès en Afrique. Face à la perte d’efficacité des outils de lutte actuels, l’Organisation Mondiale de la Santé (OMS) encourage l’exploration de nouvelles méthodes alternatives, telles que la lutte biologique à travers des micro-organismes, des parasites et des prédateurs naturels des moustiques. Les champignons entomopathogènes du genre Metarhizium spp. se distinguent par leurs résultats prometteurs en laboratoire (BILGO et al., 2018). Metarhizium spp. présente un double mode de vie : pathogène des insectes et endophyte des plantes. Cependant, les techniques d’isolement de ces champignons posent des défis, notamment en ce qui concerne le choix de milieux de culture optimaux. Cette étude vise à optimiser les techniques d’isolement des champignons Metarhizium inféodés à la rhizosphère et aux insectes dans l’Ouest du Burkina Faso. Au total 565 échantillons de rhizosphères et d’insectes ont été prélevés à Bama (11°23'N, 4°24'O), une zone de riziculture et Soumousso (11°04'N, 4°03'W), une zone de savane et de culture de maïs, tous des villages dans l’Ouest du Burkina Faso., puis cultivés sur deux milieux sélectifs enrichis d’antibiotiques à base de Potato Dextrose Agar (PDA), ’PDA + Pénicilline + Ampicilline ’’ et ‘’PDA + Gentamicine + Ampicilline. Les cultures ont été incubées à 27°C ±2°C avec 70% d’humidité pendant 21 jours. Après identification macroscopique et microscopique, les colonies suspectes ont subi une amplification de la région Internal Transcribed Spacer (ITS) par PCR pour confirmation. Parmi les milieux testés, le milieu PDA + Gentamicine +

Ampicilline s’est révélé le plus efficace pour l’isolement de Metarhizium. Selon les caractères macroscopiques et

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microscopiques, nous avons identifié 48 et 36 souches de Metarhizium spp. inféodés à la rhizosphère et aux insectes respectivement. Puis, un sous-échantillon de 50 souches dont la région ITS a été amplifiée a été utilisé pour identifier 15 souches du genre Metarhizium inféodées aux insectes et 21 souches inféodées à la rhizosphère.