Performance of StandardTM Q COVID-19 Ag and StandardTM F COVID-19 Ag FIA compared to genes detected by RT-PCR in Burkina Faso

Résumé

Introduction : Les tests de diagnostic rapide des antigènes sont une alternative aux tests moléculaires pour la détection du SARS-CoV-2 dans un contexte de ressources limitées. Cette étude visait à évaluer les performances de deux TDR Ag par rapport aux gènes détectés par RT-PCR.

Méthodes : Cette étude a été menée pendant la pandémie de COVID-19 de janvier à mai 2021 à l'Institut de Recherche en Sciences de la Santé. Au total, 156 échantillons ont été collectés, dont 86 testés positifs et 70 négatifs par RT-PCR. Elle a consisté en une évaluation de Standard^TM Q COVID-19 Ag et Standard^TM F COVID-19 Ag FIA, comparés au kit FastPlex^TM SARS-CoV-2 detection RT-PCR.

Résultats : Le nombre de positifs détectés avec chaque TDR Ag était plus élevé pour un seul gène que pour les deux gènes détectés par RT-PCR (31 vs. 18 et 26 vs. 19). En présence de deux gènes (ORF1ab et N), les deux tests sont moins sensibles (43,9% et 46,3%) que lorsque la RT-PCR détecte un seul gène ORF1ab ou N (68,9% et 57,8%). Le plus grand nombre de positifs a été détecté avec les échantillons ayant un Ct<29. Bien que les sensibilités soient faibles, la sensibilité de chaque TDR Ag est meilleure pour les charges virales élevées.

Conclusion : Cette étude a montré une faible performance des deux TDR Ag, en particulier lorsque la RT-PCR a détecté deux gènes. Leur utilisation devrait être limitée dans un contexte de forte endémicité de COVID-19 et des échantillons à faible charge virale.